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Isoform
ββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββ
top
Eine Isoform bezeichnet in der Biochemie Gene und ihre Proteine, die durch Genduplikationen entstanden und mit teilweise leichten VerΓ€nderungen mehrfach im Genom vorkommencite-ref-kahl-1-0[1] oder Proteinvarianten, die durch alternatives SpleiΓen entstehen.cite-ref-lackie-2-0[2] Isoform beschreibt in der Chemie ein MolekΓΌl identischer Zusammensetzung, aber unterschiedlichen Aufbaus im Vergleich zu einem zweiten. Manche Isoenzyme sind Isoformen, wenn sie nicht nur die gleichen Funktionen, sondern auch eine Γ€hnliche Sequenz (und genetische Verwandtschaft) aufweisen. Verwandte Gene und Pseudogene, die durch Genduplikation von einem gemeinsamen Gen-Vorfahren stammen, werden bisweilen als Isoformen bezeichnet. Der wissenschaftlich exakte Ausdruck fΓΌr diese genomischen Isoformen ist Paralog.
Contents
β’ Eigenschaften
β’ Beispiele
β’ Literatur
β’ Einzelnachweise
ββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββ
Eigenschaften
Nach einer Duplikation kΓΆnnen durch Mutationen VerΓ€nderungen in beiden ursprΓΌnglich identischen Genen entstehen, die sich teilweise auch auf die AminosΓ€uresequenz des Proteins auswirken. Ebenso verΓ€ndert sich die Sequenz eines Proteins bei einem alternativen SpleiΓen, beispielsweise bei einer VerkΓΌrzung des Proteins oder noch stΓ€rker bei einer VerΓ€nderung des Leserasters. Die Entdeckung von vielen Isoformen erklΓ€rt die relativ geringe Zahl der Gene, welche im Human Genome Project gefunden wurde: die MΓΆglichkeit, viele unterschiedliche Genprodukte herzustellen, erweitert die DiversitΓ€t des Genoms um ein Vielfaches. Gen-Isoformen kΓΆnnen mittels RT-PCR, Screening von cDNA-Banken, Western-Blots und vielen weiteren Methoden untersucht werden.
Beispiele
β’ Lactatdehydrogenasen vom Skelettmuskel (M-Typ) bzw. Herzmuskel (H-Typ); nur das H44-Enzym wird in Gegenwart von NAD+ und Pyruvat inhibiert.
β’ Kreatinkinasen besitzen zwei Untereinheiten. KKmm kommen spezifisch im Skelettmuskel vor, KKbb im Gehirn und KKmb im Herzmuskel. Ein erhΓΆhter Spiegel der KKmb-Isoform im Blut deutet z. B. eindeutig auf einen Herzinfarkt hin.
Literatur
β’ Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer: Biochemie. 6. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5.
β’ Donald Voet, Judith G. Voet: Biochemistry. 3. Auflage, John Wiley & Sons, New York 2004. ISBN 0-471-19350-X.
β’ Bruce Alberts, Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts: Molecular Biology of the Cell, 5. Auflage, Taylor & Francis 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2.
Einzelnachweise